产品货号:
ALH157
中文名称:
凋亡DNA Ladder提取试剂盒
英文名称:
Cells Apoptosis DNA Ladder Extraction Kit
产品规格:
20T|50T
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本试剂盒适用于快速提取凋亡DNA Ladder。血液和组织培养细胞在裂解/结合液中裂解后,释放出来的DNA片段在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,将盐、细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将DNA Ladder片段从硅基质膜上洗脱。
细胞发生凋亡时,染色质DNA在核小体之间发生断裂,最终形成200bp整数倍的DNA片段,这些DNA片段被提取后,经电泳及溴化乙锭染色后形成梯子状外观,谓之DNA Ladder。
- 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
- 本公司独有的裂解/结合液配方有效裂解细胞,使用本试剂盒不需要加入昂贵的蛋白酶K处理,大大降低了使用成本和加快了处理速度。
- 节省时间,简捷,单个样品操作一般可在10分钟内完成。
组分 | 20T | 50T |
裂解/结合液CB | 6mL | 15mL |
漂洗液WB | 6mL | 15mL |
洗脱缓冲液EB | 15mL | 15mL |
吸附柱AC | 20个 | 50个 |
收集管(2mL) | 20个 | 50个 |
保存:室温,有效期1年。
- 裂解/结合液CB低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。
- 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
- 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13000rpm的传统台式离心机,如Eppendorf 5415C或者类似离心机。
- 裂解/结合液CB含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
- 一般2×106培养细胞DNA产量为10~20μg,200μL人全血典型产量为3~6μg。
- 一般电泳检测时典型上样量为2~3μg纯化的DNA,如果凋亡率低,有可能只见到基因组DNA,而见不到DNA ladder,可以试试加大上样量。
- 开始实验前将需要的水浴先预热到70℃备用。
- 第一次使用前请先在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
- 取2×106个细胞(悬浮细胞或者组织培养细胞重悬在200μL PBS中)或者200μL全血(大约含有2×106个细胞)加入200μL裂解/结合液CB,立刻涡旋振荡充分混匀。
- 可选做步骤:如果RNA残留较多,影响凋亡DNA ladder的观察,可以在加入200μL裂解/结合液CB前加20μL RNase A(25mg/mL)溶液,振荡混匀,室温放置5~10分钟。
- 细胞或者全血处理起始量最大可达300μL,如果起始量介于200μL~300μL之间,则需要按比例相应提高后面使用试剂量。
- 可选做步骤:如果RNA残留较多,影响凋亡DNA ladder的观察,可以在加入200μL裂解/结合液CB前加20μL RNase A(25mg/mL)溶液,振荡混匀,室温放置5~10分钟。
- 室温(15℃~20℃)放置10分钟。
- 加入100μL异丙醇,立刻涡旋振荡充分混匀,此时可能会出现絮状沉淀。
- 上述步骤中适当力度充分混匀非常重要,混匀不充分严重降低产量。如果样品粘稠不易混匀,则可以涡旋振荡15秒。
- 将上一步混合物(包括可能有的沉淀)加入一个吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)13000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液。
- 加入700μL漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12000rpm离心30秒,弃掉废液。
- 加入500μL漂洗液WB,12000rpm离心30秒,弃掉废液。
- 将吸附柱AC放回空收集管中,13000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇影响洗脱效率和下游反应。
- 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100μL洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液事先在65~70℃水浴中预热),室温放置3~5分钟,12000rpm离心1分钟。将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2分钟,12000rpm离心1分钟。
- 洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积,但是最小体积不应少于50μL,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。
- DNA可以直接使用或者存放在-20℃,但是不要超过14天。
- 取大约2~3μg纯化的DNA电泳检测。
- 注意200μL人全血典型产量只有3~6μg。
问题 | 分析 |
没有Ladder条带,只见到未凋亡细胞的基因组条带 | 细胞未凋亡或者凋亡细胞率太低 建议:提高凋亡剂的浓度或者延长凋亡诱导时间。 |
未见到DNA Ladder条带,也未见到非凋亡细胞的基因组条带 | 分离的DNA产量太低 建议:加大起始细胞处理量,按比例扩大试剂使用量。确保做了步骤7,以免乙醇残留降低洗脱效率。 样品本身含有DNA量少(如人全血),电泳上样量太低。 建议:可以加大洗脱下来纯化DNA的电泳上样量。 |
DNA弥散,未见Ladder | 凋亡晚期,非特异的剪切DNA所致 建议:在凋亡较早期时提取DNA Ladder(或者做多个不同时期动态连续检测)。 |
背景高,DNA Ladder弱或者不明显 | RNA污染太多,影响了观测 建议:将洗脱的纯化DNA加入DNase free的RNase至终浓度2μg/mL,室温(15~20℃)放置20分钟降解污染的RNA。此外,正常细胞含有更多的RNA,凋亡细胞比例过低时易残留更多RNA,因此RNA残留较多,往往提示凋亡细胞比例过低,可以根据实际情况调整诱导条件。 |
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